El modelo de simulación hidráulica de EPANET calcula las alturas hidráulicas en los cruces y los caudales a través de enlaces con un conjunto fijo de niveles de depósito, niveles de los depósitos y demandas de agua a lo largo de una sucesión de puntos temporales. De un paso temporal al siguiente, los niveles de los embalses y las demandas de los empalmes se actualizan de acuerdo con sus normas temporales prescritas, mientras que los niveles de los depósitos se actualizan utilizando la solución de caudal actual. La solución de las alturas y los caudales en un momento dado implica resolver simultáneamente la ecuación de conservación del caudal para cada nudo y la relación de pérdida de carga en cada nudo. y la relación de pérdida de carga en cada enlace de la red. Este proceso, conocido como equilibrado hidráulico de la red, requiere el uso de una técnica iterativa para resolver las ecuaciones no lineales implicadas. EPANET emplea para ello el Algoritmo de Gradiente Global.
El intervalo de tiempo hidráulico utilizado para la simulación de periodo extendido (EPS) puede ser definido por el usuario. Un valor típico es 1 hora. Los pasos de tiempo más cortos de lo normal se producirán automáticamente siempre que ocurra uno de los siguientes eventos:
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