O modelo de simulação hidráulica do EPANET calcula cabeçotes hidráulicos em junções e taxas de fluxo por meio de links para um conjunto fixo de níveis de reservatório, níveis de tanque e demandas de água ao longo de uma sucessão de pontos no tempo. De uma etapa de tempo para a próxima, os níveis de reservatório e as demandas de junção são atualizados de acordo com seus padrões de tempo prescritos, enquanto os níveis dos tanques são atualizados usando a solução de fluxo atual. A solução para cabeças e fluxos em um determinado ponto no tempo envolve resolver simultaneamente a conservação da equação de fluxo para cada junção e a relação de perda de carga em cada link da rede. Este processo, conhecido como balanceamento hidraulicamente da rede, requer o uso de uma técnica iterativa para resolver as equações não lineares envolvidas. A EPANET emprega o Algoritmo do Gradiente Global para este propósito.
O intervalo de tempo hidráulico usado para simulação de período estendido (EPS) pode ser definido pelo usuário. Um valor típico é 1 hora. Passos de tempo mais curtos do que o normal ocorrerão automaticamente sempre que um dos seguintes eventos ocorrer:
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