A continuación se presenta un esquema de definición del modelo de aguas subterráneas de dos zonas que se utiliza en SWMM. La zona superior está no saturada con un contenido de humedad variable de ? La zona inferior está totalmente saturada y, por lo tanto, su contenido de humedad se fija en la porosidad del suelo ?
Los flujos mostrados en la figura, expresados como volumen por unidad de superficie por unidad de tiempo, consisten en lo siguiente:
Después de calcular los flujos de agua existentes durante un paso temporal determinado, se escribe un balance de masas para el cambio en el volumen de agua almacenada en cada zona, de forma que se pueda calcular una nueva profundidad del nivel freático y el contenido de humedad de la zona no saturada para el siguiente paso temporal.