O roteamento da qualidade da água nas ligações do conduíte assume que o conduíte se comporta como um reator de tanque continuamente agitado (CSTR). Embora uma suposição de reator de fluxo em pistão possa ser mais realista, as diferenças serão pequenas se o tempo de viagem através do conduíte estiver na mesma ordem que a etapa de tempo de roteamento. A concentração de um constituinte que sai do conduto no final de uma etapa de tempo é encontrada integrando a equação de conservação da massa, usando valores médios para quantidades que podem mudar ao longo do tempo, como taxa de fluxo e volume do conduto.
A modelagem da qualidade da água nos nós da unidade de armazenamento segue a mesma abordagem usada para conduítes. Para outros tipos de nós que não têm volume, a qualidade da água que sai do nó é simplesmente a concentração da mistura de toda a água que entra no nó.
A concentração de poluente em um conduíte e um nó de armazenamento será reduzida por uma reação de decaimento de primeira ordem se o coeficiente de decaimento de primeira ordem do poluente não for zero.